Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rbm27Q5SFM8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rbm27Q5SFM8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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