Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rtl5Q5DTT4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rtl5Q5DTT4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rtl5Q5DTT4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rtl5Q5DTT4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl5Q5DTT4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rtl5Q5DTT4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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