Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf608Q56A10 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf608Q56A10 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms