Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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