Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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