Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms