Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms