Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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