Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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