Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rmi2Q3UPE3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rmi2Q3UPE3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms