Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms