Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpr55Q3UJF0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gpr55Q3UJF0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gpr55Q3UJF0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms