Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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