Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorlQ3U285 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 406.8 ms