Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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