Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms