Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Rpusd2Q149F1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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