Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms