Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms