Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms