Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms