Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms