Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc4Q08624 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc4Q08624 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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