Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms