Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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