Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Thbs3Q05895 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Thbs3Q05895 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Thbs3Q05895 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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