Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdk18Q04899 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms