Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GscQ02591 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GscQ02591 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms