Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms