Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Top2aQ01320 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms