Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms