Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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