Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptprn2P80560 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ptprn2P80560 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptprn2P80560 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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