Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Otx1P80205 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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