Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tp53bp1P70399 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tp53bp1P70399 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tp53bp1P70399 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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