Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NficP70255 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms