Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
UbdP63072 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
UbdP63072 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms