Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gnb1P62874 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gnb1P62874 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms