Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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