Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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