Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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