Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Copz1P61924 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms