Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CtdsplP58465 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms