Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn18P56857 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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