Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
FmodP50608 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
FmodP50608 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms