Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms