Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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VdrP48281 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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VdrP48281 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VdrP48281 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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