Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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