Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrprbP47758 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms