Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PtgfrP43117 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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